一般认为腹泻连续二个月以上称为慢性腹泻。小儿得了慢性腹泻治疗上要分析一下原因才能对症下药。　　
⒈急性腹泻没有彻底治疗而转为慢性：这类小儿营养比较差，常常因为没有母奶而改用牛奶喂。营养差，胃酸及消化酶的分泌量少，影响消化功能，使肠道下部的正常细菌离开原来的“岗位”而到肠道的上部，把吃进的食物分解、发酵、腐败；这些酸性腐败物质刺激肠道造成腹泻迁延。可用食品治疗。　　
⒉长期应用抗生素：有的孩子因为长期应用抗生素，把肠道内不致病的“正常”细菌统统杀灭。而“正常”细菌在肠道内可以“监视”、“抑制”肠道内病菌的生长，缺乏了后者的作用，病菌大量繁殖。对这类腹泻首先应停用抗生素，并服些扶植“正常”细菌繁殖的药。
⒊其它：如对某种食物（牛奶中的蛋白质）过敏引起的腹泻，则要停服这种食物；由阿米巴原虫或梨形鞭毛虫引起的腹泻要治疗原发病；少见的如某种消化酶不足则要适当补充。有奶癣的婴儿，吃奶期间大便次数较多，但不影响生长发育。如果婴儿长时期进食量不足，也可造成“饥饿性腹泻”。